Claro, vou fornecer um exemplo de código Java que mostra como se conectar a um banco de dados MySQL usando JDBC, incluindo funções para executar consultas personalizadas, armazenar e recuperar valores. V dividir o código em várias classes para torná-lo flexível e bem definido.

Primeiro, vamos criar uma classe para lidar com a conexão banco de dados:

import java.sql.Connection;
import java.sql.DriverManager;
import java.sql.SQLException;

public class DatabaseConnector {
    private static final String URL = "jdbc:mysql://localhost:3306/nomedobanco";
    private static final String USER = "usuario";
    private static final String PASSWORD = "senha";

    public static Connection getConnection() throws SQLException {
        return DriverManager.getConnection(URL, USER, PASSWORD);
    }
}

Agora, vamos criar uma classe para lidar com consultas personalizadas:

import java.sql.Connection;
import java.sql.PreparedStatement;
import java.sql.ResultSet;
import java.sql.SQLException;

public class QueryExecutor {
    public static ResultSet executeQuery(String query) throws SQLException {
        Connection connection = DatabaseConnector.getConnection();
        PreparedStatement statement = connection.prepareStatement(query);
        return statement.executeQuery();
    }

    public static int executeUpdate(String query) throws SQLException {
        Connection connection = DatabaseConnector.getConnection();
        PreparedStatement statement = connection.prepareStatement(query);
        return statement.executeUpdate();
    }
}

Por fim, uma classe para armazenar e recuperar valores do banco de dados:

import java.sql.*;

public class DataHandler {
    public static void storeData(String data) throws SQLException {
        Connection connection = DatabaseConnector.getConnection();
        String query = "INSERT INTO tabela (coluna) VALUES (?)";
        PreparedStatement statement = connection.prepareStatement(query);
        statement.setString(1, data);
        statement.executeUpdate();
    }

    public static String retrieveData() throws SQLException {
        Connection connection = DatabaseConnector.getConnection();
        String query = "SELECT coluna FROM tabela";
        Statement statement = connection.createStatement();
        ResultSet resultSet = statement.executeQuery(query);
        if(resultSet.next()) {
            return resultSet.getString("coluna");
        } else {
            return null;
        }
    }
}

Com essas classes, você pode facilmente criar instâncias e utilizar as funções para se conectar ao banco de dados, executar consultas personalizadas, armazenar e recuper valores.

Lembre-se de substituir "nomedobanco "usuario", "senha", "tabela" e "coluna" com os valores específicos do seu ambiente.